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Outils de génétique - Blast Mycoquébec

Insérez une séquence ou récupérez-là avec un numéo GenBank et nous effectuerons une recherche Blast sur les base de données locales sélectionnées et si désiré sur GenBank en ligne.

Numéro GenBank :
?

Base de données hébergées localement (plus rapide et mis-à-jour environ 1 fois par mois) :

Mycoquébec (~10 sec.)
MycoMap (~20 sec.)
BOLD (local) (~20 sec.)
UNITE (séquences de référence) (~10 sec.)
UNITE (toutes les séquences) (~20 sec.)
Genbank TYPES (~20 sec.)

Base de données hébergées externe (plus lent et dépend de la disponibilité de l'application externe) :

Genbank (en ligne) (~50 sec.)
* Formats acceptés : Numéro GenBank, Fasta ou Plain (GATC seulement) ** Seules les séquences ITS sont indexées sur Mycoquébec.
*** Un identification est jugée significative si plus de 99,5% d'appariement et doit être manuellement validé par un expert. En autres, les espèces à évolution rapide nécessitent un seuil plus élevé (parfois 100 % d'identité) car de petites différences nucléotidiques suffisent à distinguer deux espèces. Alors que pour des espèces à évolution lente, certaines espèces morphologiquement différentes peuvent avoir des séquences ITS identiques.

Résultats :

MQ
MM
BOLD
UN (Refs)
UN (Toutes)
GB-TYPES

Aucun blast effectué sur Mycoquébec jusqu'à maintenant.